Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
ApobrQ8VBT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,35■■■□□ 2,93
ApobrQ8VBT6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
ApobrQ8VBT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
ApobrQ8VBT6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
ApobrQ8VBT6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
ApobrQ8VBT6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
ApobrQ8VBT6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,28■■■□□ 2,92
ApobrQ8VBT6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
ApobrQ8VBT6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,27■■■□□ 2,92
ApobrQ8VBT6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,26■■■□□ 2,91
ApobrQ8VBT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
ApobrQ8VBT6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
ApobrQ8VBT6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
ApobrQ8VBT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
ApobrQ8VBT6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33,2■■■□□ 2,91
ApobrQ8VBT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
ApobrQ8VBT6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
ApobrQ8VBT6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
ApobrQ8VBT6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
ApobrQ8VBT6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
ApobrQ8VBT6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
ApobrQ8VBT6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
ApobrQ8VBT6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
ApobrQ8VBT6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33,07■■■□□ 2,89
ApobrQ8VBT6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33,07■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,03■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
ApobrQ8VBT6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
ApobrQ8VBT6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
ApobrQ8VBT6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,98■■■□□ 2,87
ApobrQ8VBT6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32,98■■■□□ 2,87
ApobrQ8VBT6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
ApobrQ8VBT6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
ApobrQ8VBT6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
ApobrQ8VBT6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32,94■■■□□ 2,86
ApobrQ8VBT6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
ApobrQ8VBT6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
ApobrQ8VBT6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
ApobrQ8VBT6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32,87■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
ApobrQ8VBT6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
ApobrQ8VBT6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
ApobrQ8VBT6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
ApobrQ8VBT6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32,79■■■□□ 2,84
ApobrQ8VBT6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
ApobrQ8VBT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
ApobrQ8VBT6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32,77■■■□□ 2,84
ApobrQ8VBT6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32,75■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,7■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32,7■■■□□ 2,83
ApobrQ8VBT6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,66■■■□□ 2,82
ApobrQ8VBT6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
ApobrQ8VBT6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
ApobrQ8VBT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
ApobrQ8VBT6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
ApobrQ8VBT6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32,6■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32,59■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32,58■■■□□ 2,81
ApobrQ8VBT6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
ApobrQ8VBT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32,54■■■□□ 2,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms