Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup35Q8R4R6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup35Q8R4R6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup35Q8R4R6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup35Q8R4R6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup35Q8R4R6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup35Q8R4R6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup35Q8R4R6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup35Q8R4R6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup35Q8R4R6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup35Q8R4R6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup35Q8R4R6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup35Q8R4R6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup35Q8R4R6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup35Q8R4R6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup35Q8R4R6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms