Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc58Q8R3Q6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc58Q8R3Q6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc58Q8R3Q6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc58Q8R3Q6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc58Q8R3Q6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc58Q8R3Q6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc58Q8R3Q6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc58Q8R3Q6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc58Q8R3Q6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc58Q8R3Q6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc58Q8R3Q6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc58Q8R3Q6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc58Q8R3Q6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc58Q8R3Q6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc58Q8R3Q6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc58Q8R3Q6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc58Q8R3Q6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms