Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Utp4Q8R2N2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Utp4Q8R2N2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Utp4Q8R2N2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp4Q8R2N2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp4Q8R2N2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp4Q8R2N2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp4Q8R2N2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms