Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r212Q8R268 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r212Q8R268 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r212Q8R268 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r212Q8R268 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r212Q8R268 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r212Q8R268 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r212Q8R268 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r212Q8R268 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r212Q8R268 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r212Q8R268 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r212Q8R268 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r212Q8R268 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r212Q8R268 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r212Q8R268 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r212Q8R268 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r212Q8R268 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r212Q8R268 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r212Q8R268 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r212Q8R268 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r212Q8R268 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r212Q8R268 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r212Q8R268 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms