Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZW7

Gabrp, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrpQ8QZW7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabrpQ8QZW7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabrpQ8QZW7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabrpQ8QZW7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabrpQ8QZW7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabrpQ8QZW7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabrpQ8QZW7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabrpQ8QZW7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabrpQ8QZW7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabrpQ8QZW7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabrpQ8QZW7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabrpQ8QZW7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GabrpQ8QZW7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabrpQ8QZW7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GabrpQ8QZW7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GabrpQ8QZW7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabrpQ8QZW7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GabrpQ8QZW7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GabrpQ8QZW7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabrpQ8QZW7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabrpQ8QZW7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.4 ms