Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ssh3Q8K330 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ssh3Q8K330 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ssh3Q8K330 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ssh3Q8K330 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Ssh3Q8K330 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,71■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,55
Ssh3Q8K330 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ssh3Q8K330 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ssh3Q8K330 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,58■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ssh3Q8K330 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,9 ms