Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mrpl47Q8K2Y7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mrpl47Q8K2Y7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl47Q8K2Y7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl47Q8K2Y7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl47Q8K2Y7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl47Q8K2Y7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrpl47Q8K2Y7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms