Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Shtn1Q8K2Q9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Shtn1Q8K2Q9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Shtn1Q8K2Q9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Shtn1Q8K2Q9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Shtn1Q8K2Q9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Shtn1Q8K2Q9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Shtn1Q8K2Q9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Shtn1Q8K2Q9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Shtn1Q8K2Q9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Shtn1Q8K2Q9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Shtn1Q8K2Q9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Shtn1Q8K2Q9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Shtn1Q8K2Q9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Shtn1Q8K2Q9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Shtn1Q8K2Q9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Shtn1Q8K2Q9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Shtn1Q8K2Q9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Shtn1Q8K2Q9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Shtn1Q8K2Q9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Shtn1Q8K2Q9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Shtn1Q8K2Q9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Shtn1Q8K2Q9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Shtn1Q8K2Q9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Shtn1Q8K2Q9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Shtn1Q8K2Q9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Shtn1Q8K2Q9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Shtn1Q8K2Q9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Shtn1Q8K2Q9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Shtn1Q8K2Q9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Shtn1Q8K2Q9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Shtn1Q8K2Q9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Shtn1Q8K2Q9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Shtn1Q8K2Q9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Shtn1Q8K2Q9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Shtn1Q8K2Q9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Shtn1Q8K2Q9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Shtn1Q8K2Q9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Shtn1Q8K2Q9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Shtn1Q8K2Q9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,14■■■□□ 2,41
Shtn1Q8K2Q9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Shtn1Q8K2Q9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Shtn1Q8K2Q9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Shtn1Q8K2Q9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Shtn1Q8K2Q9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Shtn1Q8K2Q9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Shtn1Q8K2Q9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Shtn1Q8K2Q9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Shtn1Q8K2Q9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Shtn1Q8K2Q9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Shtn1Q8K2Q9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Shtn1Q8K2Q9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Shtn1Q8K2Q9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Shtn1Q8K2Q9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Shtn1Q8K2Q9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Shtn1Q8K2Q9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29,95■■■□□ 2,38
Shtn1Q8K2Q9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Shtn1Q8K2Q9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Shtn1Q8K2Q9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Shtn1Q8K2Q9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Shtn1Q8K2Q9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms