Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Otud6bQ8K2H2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Otud6bQ8K2H2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otud6bQ8K2H2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Otud6bQ8K2H2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Otud6bQ8K2H2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Otud6bQ8K2H2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Otud6bQ8K2H2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Otud6bQ8K2H2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otud6bQ8K2H2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Otud6bQ8K2H2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Otud6bQ8K2H2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Otud6bQ8K2H2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Otud6bQ8K2H2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Otud6bQ8K2H2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Otud6bQ8K2H2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Otud6bQ8K2H2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Otud6bQ8K2H2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Otud6bQ8K2H2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Otud6bQ8K2H2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otud6bQ8K2H2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otud6bQ8K2H2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otud6bQ8K2H2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Otud6bQ8K2H2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Otud6bQ8K2H2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Otud6bQ8K2H2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Otud6bQ8K2H2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otud6bQ8K2H2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Otud6bQ8K2H2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Otud6bQ8K2H2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Otud6bQ8K2H2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otud6bQ8K2H2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otud6bQ8K2H2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otud6bQ8K2H2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Otud6bQ8K2H2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Otud6bQ8K2H2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Otud6bQ8K2H2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Otud6bQ8K2H2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms