Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfip2Q8K221 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arfip2Q8K221 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arfip2Q8K221 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arfip2Q8K221 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arfip2Q8K221 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfip2Q8K221 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arfip2Q8K221 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arfip2Q8K221 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arfip2Q8K221 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfip2Q8K221 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms