Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1K9

Hinfp, Histone H4 transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HinfpQ8K1K9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HinfpQ8K1K9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HinfpQ8K1K9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HinfpQ8K1K9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HinfpQ8K1K9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HinfpQ8K1K9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HinfpQ8K1K9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HinfpQ8K1K9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HinfpQ8K1K9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HinfpQ8K1K9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HinfpQ8K1K9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HinfpQ8K1K9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HinfpQ8K1K9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HinfpQ8K1K9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms