Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8K039 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8K039 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8K039 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8K039 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8K039 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q8K039 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8K039 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8K039 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8K039 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q8K039 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8K039 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8K039 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8K039 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8K039 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8K039 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8K039 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q8K039 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8K039 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8K039 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8K039 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8K039 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8K039 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8K039 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8K039 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8K039 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8K039 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8K039 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8K039 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8K039 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8K039 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8K039 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8K039 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8K039 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8K039 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8K039 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8K039 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8K039 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8K039 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8K039 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8K039 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8K039 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8K039 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8K039 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8K039 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8K039 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8K039 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8K039 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8K039 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8K039 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8K039 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8K039 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8K039 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8K039 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8K039 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8K039 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8K039 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8K039 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8K039 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8K039 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8K039 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8K039 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8K039 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8K039 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8K039 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8K039 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8K039 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8K039 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8K039 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8K039 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8K039 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8K039 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8K039 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8K039 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8K039 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8K039 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8K039 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8K039 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8K039 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8K039 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8K039 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8K039 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8K039 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8K039 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8K039 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8K039 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8K039 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8K039 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8K039 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8K039 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8K039 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8K039 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8K039 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8K039 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8K039 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8K039 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8K039 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8K039 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8K039 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8K039 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms