Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TwnkQ8CIW5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TwnkQ8CIW5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TwnkQ8CIW5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TwnkQ8CIW5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TwnkQ8CIW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TwnkQ8CIW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TwnkQ8CIW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TwnkQ8CIW5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TwnkQ8CIW5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TwnkQ8CIW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TwnkQ8CIW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TwnkQ8CIW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TwnkQ8CIW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TwnkQ8CIW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TwnkQ8CIW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TwnkQ8CIW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TwnkQ8CIW5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TwnkQ8CIW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TwnkQ8CIW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TwnkQ8CIW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms