Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CopaQ8CIE6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CopaQ8CIE6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CopaQ8CIE6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CopaQ8CIE6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CopaQ8CIE6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CopaQ8CIE6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms