Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nupl2Q8CIC2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nupl2Q8CIC2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nupl2Q8CIC2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nupl2Q8CIC2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nupl2Q8CIC2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nupl2Q8CIC2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nupl2Q8CIC2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nupl2Q8CIC2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nupl2Q8CIC2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nupl2Q8CIC2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nupl2Q8CIC2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nupl2Q8CIC2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nupl2Q8CIC2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nupl2Q8CIC2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nupl2Q8CIC2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms