Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Trim32Q8CH72 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Trim32Q8CH72 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Trim32Q8CH72 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Trim32Q8CH72 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Trim32Q8CH72 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Trim32Q8CH72 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Trim32Q8CH72 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Trim32Q8CH72 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Trim32Q8CH72 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Trim32Q8CH72 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trim32Q8CH72 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trim32Q8CH72 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trim32Q8CH72 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Trim32Q8CH72 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trim32Q8CH72 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trim32Q8CH72 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Trim32Q8CH72 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Trim32Q8CH72 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Trim32Q8CH72 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Trim32Q8CH72 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Trim32Q8CH72 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Trim32Q8CH72 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Trim32Q8CH72 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trim32Q8CH72 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trim32Q8CH72 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Trim32Q8CH72 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Trim32Q8CH72 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Trim32Q8CH72 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Trim32Q8CH72 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Trim32Q8CH72 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Trim32Q8CH72 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Trim32Q8CH72 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Trim32Q8CH72 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Trim32Q8CH72 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Trim32Q8CH72 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Trim32Q8CH72 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Trim32Q8CH72 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Trim32Q8CH72 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Trim32Q8CH72 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Trim32Q8CH72 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Trim32Q8CH72 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Trim32Q8CH72 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Trim32Q8CH72 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Trim32Q8CH72 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Trim32Q8CH72 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Trim32Q8CH72 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72,4 ms