Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm9955Q8CEJ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm9955Q8CEJ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm9955Q8CEJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms