Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vcpip1Q8CDG3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vcpip1Q8CDG3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vcpip1Q8CDG3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vcpip1Q8CDG3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vcpip1Q8CDG3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vcpip1Q8CDG3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vcpip1Q8CDG3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vcpip1Q8CDG3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vcpip1Q8CDG3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Vcpip1Q8CDG3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vcpip1Q8CDG3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vcpip1Q8CDG3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vcpip1Q8CDG3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vcpip1Q8CDG3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vcpip1Q8CDG3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vcpip1Q8CDG3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vcpip1Q8CDG3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms