Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD8

Kctd20, BTB/POZ domain-containing protein KCTD20, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd20Q8CDD8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd20Q8CDD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd20Q8CDD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Kctd20Q8CDD8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kctd20Q8CDD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd20Q8CDD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd20Q8CDD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd20Q8CDD8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd20Q8CDD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd20Q8CDD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd20Q8CDD8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd20Q8CDD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd20Q8CDD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd20Q8CDD8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kctd20Q8CDD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kctd20Q8CDD8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kctd20Q8CDD8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kctd20Q8CDD8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kctd20Q8CDD8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms