Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Lin52Q8CD94 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Lin52Q8CD94 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Lin52Q8CD94 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,16■■□□□ 1,46
Lin52Q8CD94 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
Lin52Q8CD94 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Lin52Q8CD94 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,46
Lin52Q8CD94 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Lin52Q8CD94 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Lin52Q8CD94 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Lin52Q8CD94 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Lin52Q8CD94 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Lin52Q8CD94 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Lin52Q8CD94 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Lin52Q8CD94 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Lin52Q8CD94 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Lin52Q8CD94 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23,83■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Lin52Q8CD94 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Lin52Q8CD94 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Lin52Q8CD94 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Lin52Q8CD94 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Lin52Q8CD94 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Lin52Q8CD94 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Lin52Q8CD94 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Lin52Q8CD94 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Lin52Q8CD94 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,4 ms