Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacnb2Q8CC27 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacnb2Q8CC27 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacnb2Q8CC27 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacnb2Q8CC27 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacnb2Q8CC27 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacnb2Q8CC27 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacnb2Q8CC27 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacnb2Q8CC27 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacnb2Q8CC27 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacnb2Q8CC27 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb2Q8CC27 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacnb2Q8CC27 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacnb2Q8CC27 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacnb2Q8CC27 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacnb2Q8CC27 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacnb2Q8CC27 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb2Q8CC27 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacnb2Q8CC27 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacnb2Q8CC27 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacnb2Q8CC27 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacnb2Q8CC27 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacnb2Q8CC27 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacnb2Q8CC27 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacnb2Q8CC27 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacnb2Q8CC27 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacnb2Q8CC27 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms