Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Spef2Q8C9J3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Spef2Q8C9J3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Spef2Q8C9J3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Spef2Q8C9J3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Spef2Q8C9J3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Spef2Q8C9J3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Spef2Q8C9J3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Spef2Q8C9J3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Spef2Q8C9J3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Spef2Q8C9J3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Spef2Q8C9J3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Spef2Q8C9J3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Spef2Q8C9J3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Spef2Q8C9J3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Spef2Q8C9J3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Spef2Q8C9J3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Spef2Q8C9J3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Spef2Q8C9J3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Spef2Q8C9J3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Spef2Q8C9J3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Spef2Q8C9J3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Spef2Q8C9J3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Spef2Q8C9J3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Spef2Q8C9J3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Spef2Q8C9J3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Spef2Q8C9J3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Spef2Q8C9J3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Spef2Q8C9J3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Spef2Q8C9J3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Spef2Q8C9J3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Spef2Q8C9J3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Spef2Q8C9J3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Spef2Q8C9J3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Spef2Q8C9J3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Spef2Q8C9J3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Spef2Q8C9J3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Spef2Q8C9J3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Spef2Q8C9J3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Spef2Q8C9J3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Spef2Q8C9J3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Spef2Q8C9J3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Spef2Q8C9J3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Spef2Q8C9J3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Spef2Q8C9J3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Spef2Q8C9J3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spef2Q8C9J3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spef2Q8C9J3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spef2Q8C9J3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spef2Q8C9J3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Spef2Q8C9J3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Spef2Q8C9J3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Spef2Q8C9J3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms