Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms