Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5X1

4931406P16Rik, RIKEN cDNA 4931406P16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406P16RikQ8C5X1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4931406P16RikQ8C5X1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4931406P16RikQ8C5X1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.52■■■□□ 2
4931406P16RikQ8C5X1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
4931406P16RikQ8C5X1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4931406P16RikQ8C5X1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4931406P16RikQ8C5X1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4931406P16RikQ8C5X1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4931406P16RikQ8C5X1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4931406P16RikQ8C5X1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4931406P16RikQ8C5X1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
4931406P16RikQ8C5X1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
4931406P16RikQ8C5X1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4931406P16RikQ8C5X1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4931406P16RikQ8C5X1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4931406P16RikQ8C5X1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4931406P16RikQ8C5X1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4931406P16RikQ8C5X1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
4931406P16RikQ8C5X1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4931406P16RikQ8C5X1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4931406P16RikQ8C5X1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4931406P16RikQ8C5X1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4931406P16RikQ8C5X1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4931406P16RikQ8C5X1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4931406P16RikQ8C5X1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4931406P16RikQ8C5X1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4931406P16RikQ8C5X1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4931406P16RikQ8C5X1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
4931406P16RikQ8C5X1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4931406P16RikQ8C5X1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
4931406P16RikQ8C5X1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
4931406P16RikQ8C5X1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4931406P16RikQ8C5X1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
4931406P16RikQ8C5X1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4931406P16RikQ8C5X1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4931406P16RikQ8C5X1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4931406P16RikQ8C5X1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4931406P16RikQ8C5X1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
4931406P16RikQ8C5X1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4931406P16RikQ8C5X1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
4931406P16RikQ8C5X1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4931406P16RikQ8C5X1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4931406P16RikQ8C5X1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4931406P16RikQ8C5X1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
4931406P16RikQ8C5X1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
4931406P16RikQ8C5X1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4931406P16RikQ8C5X1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4931406P16RikQ8C5X1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4931406P16RikQ8C5X1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4931406P16RikQ8C5X1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
4931406P16RikQ8C5X1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
4931406P16RikQ8C5X1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
4931406P16RikQ8C5X1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
4931406P16RikQ8C5X1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4931406P16RikQ8C5X1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4931406P16RikQ8C5X1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms