Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1P2

Defa21, Alpha-defensin 21, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa21Q8C1P2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa21Q8C1P2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa21Q8C1P2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa21Q8C1P2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa21Q8C1P2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa21Q8C1P2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa21Q8C1P2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa21Q8C1P2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa21Q8C1P2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa21Q8C1P2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa21Q8C1P2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa21Q8C1P2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa21Q8C1P2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa21Q8C1P2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa21Q8C1P2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms