Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6ka5Q8C050 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rps6ka5Q8C050 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka5Q8C050 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka5Q8C050 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6ka5Q8C050 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6ka5Q8C050 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6ka5Q8C050 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6ka5Q8C050 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps6ka5Q8C050 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps6ka5Q8C050 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6ka5Q8C050 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rps6ka5Q8C050 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps6ka5Q8C050 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps6ka5Q8C050 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps6ka5Q8C050 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6ka5Q8C050 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6ka5Q8C050 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rps6ka5Q8C050 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rps6ka5Q8C050 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps6ka5Q8C050 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps6ka5Q8C050 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps6ka5Q8C050 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6ka5Q8C050 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6ka5Q8C050 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka5Q8C050 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka5Q8C050 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka5Q8C050 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka5Q8C050 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka5Q8C050 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka5Q8C050 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka5Q8C050 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rps6ka5Q8C050 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rps6ka5Q8C050 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka5Q8C050 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rps6ka5Q8C050 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka5Q8C050 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka5Q8C050 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka5Q8C050 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rps6ka5Q8C050 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rps6ka5Q8C050 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rps6ka5Q8C050 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rps6ka5Q8C050 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rps6ka5Q8C050 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rps6ka5Q8C050 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rps6ka5Q8C050 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rps6ka5Q8C050 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rps6ka5Q8C050 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rps6ka5Q8C050 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rps6ka5Q8C050 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rps6ka5Q8C050 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms