Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms