Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arfrp1Q8BXL7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfrp1Q8BXL7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfrp1Q8BXL7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfrp1Q8BXL7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Arfrp1Q8BXL7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfrp1Q8BXL7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms