Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Larp4Q8BWW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Larp4Q8BWW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Larp4Q8BWW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Larp4Q8BWW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Larp4Q8BWW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Larp4Q8BWW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Larp4Q8BWW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Larp4Q8BWW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Larp4Q8BWW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Larp4Q8BWW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Larp4Q8BWW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Larp4Q8BWW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Larp4Q8BWW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Larp4Q8BWW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Larp4Q8BWW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Larp4Q8BWW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Larp4Q8BWW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Larp4Q8BWW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Larp4Q8BWW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Larp4Q8BWW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Larp4Q8BWW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Larp4Q8BWW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Larp4Q8BWW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Larp4Q8BWW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Larp4Q8BWW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Larp4Q8BWW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms