Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVK9

Sp110, Sp110 nuclear body protein, mousemouse

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp110Q8BVK9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sp110Q8BVK9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sp110Q8BVK9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sp110Q8BVK9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sp110Q8BVK9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sp110Q8BVK9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp110Q8BVK9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp110Q8BVK9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sp110Q8BVK9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sp110Q8BVK9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sp110Q8BVK9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sp110Q8BVK9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp110Q8BVK9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp110Q8BVK9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp110Q8BVK9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp110Q8BVK9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sp110Q8BVK9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sp110Q8BVK9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sp110Q8BVK9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp110Q8BVK9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sp110Q8BVK9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sp110Q8BVK9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sp110Q8BVK9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp110Q8BVK9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp110Q8BVK9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp110Q8BVK9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sp110Q8BVK9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp110Q8BVK9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp110Q8BVK9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp110Q8BVK9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp110Q8BVK9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sp110Q8BVK9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp110Q8BVK9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp110Q8BVK9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms