Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifi44Q8BV66 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifi44Q8BV66 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifi44Q8BV66 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifi44Q8BV66 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifi44Q8BV66 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ifi44Q8BV66 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifi44Q8BV66 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifi44Q8BV66 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi44Q8BV66 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi44Q8BV66 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi44Q8BV66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi44Q8BV66 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi44Q8BV66 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms