Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Bicd1Q8BR07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Bicd1Q8BR07 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Bicd1Q8BR07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Bicd1Q8BR07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Bicd1Q8BR07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Bicd1Q8BR07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Bicd1Q8BR07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Bicd1Q8BR07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Bicd1Q8BR07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Bicd1Q8BR07 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Bicd1Q8BR07 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms