Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH97

Rcn3, Reticulocalbin-3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn3Q8BH97 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcn3Q8BH97 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcn3Q8BH97 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcn3Q8BH97 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rcn3Q8BH97 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rcn3Q8BH97 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcn3Q8BH97 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcn3Q8BH97 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rcn3Q8BH97 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcn3Q8BH97 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn3Q8BH97 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rcn3Q8BH97 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcn3Q8BH97 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcn3Q8BH97 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcn3Q8BH97 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcn3Q8BH97 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms