Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot10Q8BH15 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot10Q8BH15 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot10Q8BH15 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot10Q8BH15 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot10Q8BH15 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnot10Q8BH15 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnot10Q8BH15 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnot10Q8BH15 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnot10Q8BH15 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot10Q8BH15 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot10Q8BH15 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot10Q8BH15 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot10Q8BH15 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms