Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt12Q8BG71 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt12Q8BG71 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt12Q8BG71 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt12Q8BG71 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt12Q8BG71 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt12Q8BG71 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trmt12Q8BG71 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt12Q8BG71 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trmt12Q8BG71 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt12Q8BG71 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt12Q8BG71 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt12Q8BG71 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt12Q8BG71 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt12Q8BG71 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt12Q8BG71 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trmt12Q8BG71 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trmt12Q8BG71 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt12Q8BG71 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt12Q8BG71 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt12Q8BG71 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt12Q8BG71 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt12Q8BG71 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt12Q8BG71 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt12Q8BG71 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt12Q8BG71 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt12Q8BG71 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms