Protein–RNA interactions for Protein: Q80W99

Catsper3, Cation channel sperm-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper3Q80W99 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Catsper3Q80W99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Catsper3Q80W99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Catsper3Q80W99 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Catsper3Q80W99 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Catsper3Q80W99 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Catsper3Q80W99 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Catsper3Q80W99 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Catsper3Q80W99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Catsper3Q80W99 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms