Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rims3Q80U57 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rims3Q80U57 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rims3Q80U57 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rims3Q80U57 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rims3Q80U57 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims3Q80U57 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims3Q80U57 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims3Q80U57 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims3Q80U57 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims3Q80U57 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims3Q80U57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rims3Q80U57 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rims3Q80U57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms