Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Nek5Q7TSC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Nek5Q7TSC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Nek5Q7TSC3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Nek5Q7TSC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Nek5Q7TSC3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Nek5Q7TSC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Nek5Q7TSC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Nek5Q7TSC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Nek5Q7TSC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Nek5Q7TSC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Nek5Q7TSC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Nek5Q7TSC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Nek5Q7TSC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Nek5Q7TSC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Nek5Q7TSC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Nek5Q7TSC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Nek5Q7TSC3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Nek5Q7TSC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Nek5Q7TSC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms