Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mycbp2Q7TPH6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mycbp2Q7TPH6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mycbp2Q7TPH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mycbp2Q7TPH6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mycbp2Q7TPH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mycbp2Q7TPH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mycbp2Q7TPH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms