Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim46Q7TNM2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim46Q7TNM2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim46Q7TNM2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim46Q7TNM2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim46Q7TNM2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim46Q7TNM2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim46Q7TNM2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim46Q7TNM2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim46Q7TNM2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim46Q7TNM2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim46Q7TNM2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim46Q7TNM2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim46Q7TNM2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim46Q7TNM2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms