Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sbno2Q7TNB8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sbno2Q7TNB8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sbno2Q7TNB8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sbno2Q7TNB8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sbno2Q7TNB8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno2Q7TNB8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno2Q7TNB8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sbno2Q7TNB8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sbno2Q7TNB8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sbno2Q7TNB8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sbno2Q7TNB8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sbno2Q7TNB8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sbno2Q7TNB8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sbno2Q7TNB8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sbno2Q7TNB8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sbno2Q7TNB8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sbno2Q7TNB8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sbno2Q7TNB8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sbno2Q7TNB8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sbno2Q7TNB8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Sbno2Q7TNB8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sbno2Q7TNB8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sbno2Q7TNB8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sbno2Q7TNB8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sbno2Q7TNB8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sbno2Q7TNB8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sbno2Q7TNB8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sbno2Q7TNB8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sbno2Q7TNB8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sbno2Q7TNB8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Sbno2Q7TNB8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sbno2Q7TNB8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sbno2Q7TNB8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sbno2Q7TNB8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sbno2Q7TNB8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sbno2Q7TNB8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sbno2Q7TNB8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sbno2Q7TNB8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sbno2Q7TNB8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sbno2Q7TNB8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms