Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN37

Trpm4, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm4Q7TN37 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Trpm4Q7TN37 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trpm4Q7TN37 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trpm4Q7TN37 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Trpm4Q7TN37 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Trpm4Q7TN37 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trpm4Q7TN37 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trpm4Q7TN37 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Trpm4Q7TN37 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Trpm4Q7TN37 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Trpm4Q7TN37 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Trpm4Q7TN37 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trpm4Q7TN37 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Trpm4Q7TN37 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,68
Trpm4Q7TN37 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Trpm4Q7TN37 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trpm4Q7TN37 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Trpm4Q7TN37 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trpm4Q7TN37 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Trpm4Q7TN37 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Trpm4Q7TN37 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trpm4Q7TN37 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trpm4Q7TN37 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trpm4Q7TN37 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Trpm4Q7TN37 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms