Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smap2Q7TN29 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smap2Q7TN29 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smap2Q7TN29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smap2Q7TN29 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smap2Q7TN29 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smap2Q7TN29 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smap2Q7TN29 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smap2Q7TN29 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smap2Q7TN29 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smap2Q7TN29 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smap2Q7TN29 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smap2Q7TN29 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smap2Q7TN29 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms