Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps27lQ6ZWY3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps27lQ6ZWY3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps27lQ6ZWY3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps27lQ6ZWY3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps27lQ6ZWY3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps27lQ6ZWY3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps27lQ6ZWY3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps27lQ6ZWY3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps27lQ6ZWY3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps27lQ6ZWY3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps27lQ6ZWY3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps27lQ6ZWY3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps27lQ6ZWY3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps27lQ6ZWY3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps27lQ6ZWY3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps27lQ6ZWY3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps27lQ6ZWY3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps27lQ6ZWY3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps27lQ6ZWY3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps27lQ6ZWY3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps27lQ6ZWY3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps27lQ6ZWY3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps27lQ6ZWY3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps27lQ6ZWY3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms