Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nemp1Q6ZQE4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nemp1Q6ZQE4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nemp1Q6ZQE4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nemp1Q6ZQE4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nemp1Q6ZQE4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nemp1Q6ZQE4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nemp1Q6ZQE4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nemp1Q6ZQE4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nemp1Q6ZQE4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nemp1Q6ZQE4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nemp1Q6ZQE4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nemp1Q6ZQE4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nemp1Q6ZQE4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nemp1Q6ZQE4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nemp1Q6ZQE4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nemp1Q6ZQE4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nemp1Q6ZQE4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nemp1Q6ZQE4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nemp1Q6ZQE4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nemp1Q6ZQE4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nemp1Q6ZQE4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms