Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp34Q6ZQ93 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp34Q6ZQ93 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp34Q6ZQ93 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp34Q6ZQ93 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp34Q6ZQ93 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp34Q6ZQ93 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp34Q6ZQ93 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp34Q6ZQ93 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp34Q6ZQ93 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp34Q6ZQ93 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp34Q6ZQ93 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp34Q6ZQ93 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp34Q6ZQ93 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp34Q6ZQ93 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp34Q6ZQ93 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp34Q6ZQ93 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp34Q6ZQ93 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp34Q6ZQ93 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp34Q6ZQ93 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp34Q6ZQ93 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp34Q6ZQ93 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp34Q6ZQ93 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp34Q6ZQ93 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp34Q6ZQ93 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp34Q6ZQ93 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp34Q6ZQ93 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp34Q6ZQ93 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp34Q6ZQ93 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp34Q6ZQ93 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp34Q6ZQ93 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Usp34Q6ZQ93 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp34Q6ZQ93 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp34Q6ZQ93 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp34Q6ZQ93 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp34Q6ZQ93 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp34Q6ZQ93 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp34Q6ZQ93 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp34Q6ZQ93 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp34Q6ZQ93 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp34Q6ZQ93 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp34Q6ZQ93 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp34Q6ZQ93 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp34Q6ZQ93 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp34Q6ZQ93 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp34Q6ZQ93 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp34Q6ZQ93 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp34Q6ZQ93 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp34Q6ZQ93 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp34Q6ZQ93 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp34Q6ZQ93 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp34Q6ZQ93 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp34Q6ZQ93 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp34Q6ZQ93 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp34Q6ZQ93 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp34Q6ZQ93 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp34Q6ZQ93 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp34Q6ZQ93 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp34Q6ZQ93 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp34Q6ZQ93 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp34Q6ZQ93 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp34Q6ZQ93 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp34Q6ZQ93 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp34Q6ZQ93 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp34Q6ZQ93 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp34Q6ZQ93 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp34Q6ZQ93 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp34Q6ZQ93 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp34Q6ZQ93 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp34Q6ZQ93 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp34Q6ZQ93 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp34Q6ZQ93 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp34Q6ZQ93 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp34Q6ZQ93 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp34Q6ZQ93 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp34Q6ZQ93 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp34Q6ZQ93 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms