Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smpd4Q6ZPR5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smpd4Q6ZPR5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smpd4Q6ZPR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smpd4Q6ZPR5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smpd4Q6ZPR5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smpd4Q6ZPR5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smpd4Q6ZPR5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smpd4Q6ZPR5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smpd4Q6ZPR5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smpd4Q6ZPR5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smpd4Q6ZPR5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd4Q6ZPR5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd4Q6ZPR5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd4Q6ZPR5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smpd4Q6ZPR5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd4Q6ZPR5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smpd4Q6ZPR5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smpd4Q6ZPR5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms