Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Kcnt1Q6ZPR4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Kcnt1Q6ZPR4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Kcnt1Q6ZPR4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Kcnt1Q6ZPR4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Kcnt1Q6ZPR4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Kcnt1Q6ZPR4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Kcnt1Q6ZPR4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Kcnt1Q6ZPR4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Kcnt1Q6ZPR4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Kcnt1Q6ZPR4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,01■■□□□ 1,92
Kcnt1Q6ZPR4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Kcnt1Q6ZPR4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Kcnt1Q6ZPR4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Kcnt1Q6ZPR4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Kcnt1Q6ZPR4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Kcnt1Q6ZPR4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Kcnt1Q6ZPR4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Kcnt1Q6ZPR4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Kcnt1Q6ZPR4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Kcnt1Q6ZPR4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms