Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ube2oQ6ZPJ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ube2oQ6ZPJ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ube2oQ6ZPJ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ube2oQ6ZPJ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ube2oQ6ZPJ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ube2oQ6ZPJ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ube2oQ6ZPJ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ube2oQ6ZPJ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ube2oQ6ZPJ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ube2oQ6ZPJ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ube2oQ6ZPJ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ube2oQ6ZPJ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ube2oQ6ZPJ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ube2oQ6ZPJ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ube2oQ6ZPJ3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ube2oQ6ZPJ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ube2oQ6ZPJ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ube2oQ6ZPJ3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ube2oQ6ZPJ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ube2oQ6ZPJ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ube2oQ6ZPJ3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ube2oQ6ZPJ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ube2oQ6ZPJ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ube2oQ6ZPJ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ube2oQ6ZPJ3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ube2oQ6ZPJ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms