Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJE0

Gfral, GDNF family receptor alpha-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GfralQ6SJE0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GfralQ6SJE0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GfralQ6SJE0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GfralQ6SJE0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GfralQ6SJE0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GfralQ6SJE0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GfralQ6SJE0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GfralQ6SJE0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GfralQ6SJE0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GfralQ6SJE0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GfralQ6SJE0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GfralQ6SJE0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GfralQ6SJE0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GfralQ6SJE0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GfralQ6SJE0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GfralQ6SJE0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GfralQ6SJE0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GfralQ6SJE0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GfralQ6SJE0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GfralQ6SJE0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GfralQ6SJE0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms